CyanogenMod 9 Nightlies это пока не финальная версия популярной прошивки, и в ней все еще имеются некоторые ошибки и недоработки.
Так, владельцы Samsung Galaxy S III, установившие эту прошивку, не смогут воспользоваться FM-радио. Имеются в ней и некоторые сложности с LED-вспышкой, а также переходом смартфона в рабочий режим с помощью клавиш регулирования громкости, «поскольку у устройства очень глубокий сон, и оно не воспринимает нажатия клавиш».